Học sinh các Đội tuyển Toán, Tin, Lý, Hóa, Sinh của Trường THPT chuyên KHTN đã giành được 47 giải trong Kỳ thi Học sinh giỏi Quốc gia 2013; trong đó có 2 giải Nhất, 16 giải Nhì, 19 giải Ba và 10 giải Khuyến khích.

Danh sách học sinh đoạt giải cụ thể như sau: